Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tcirg1Q9JHF5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tcirg1Q9JHF5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms