Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms