Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
OtofQ9ESF1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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