Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cmtm7Q9ESD6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms