Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ush1cQ9ES64 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ush1cQ9ES64 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms