Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm649-201ENSMUST00000117284 1054 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ms4a4bQ9ES61 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 6430710M23Rik-201ENSMUST00000210843 1191 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 2410003L11Rik-202ENSMUST00000145262 642 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 2700097O09Rik-201ENSMUST00000021406 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ms4a4bQ9ES61 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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