Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trhr2Q9ERT2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Trhr2Q9ERT2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms