Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Chrnb2Q9ERK7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Chrnb2Q9ERK7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms