Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Clstn2Q9ER65 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Clstn2Q9ER65 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms