Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Capn12Q9ER56 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms