Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stx12Q9ER00 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms