Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR4

Clca3a2, Chloride channel accessory 3A2, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a2Q9EQR4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clca3a2Q9EQR4 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clca3a2Q9EQR4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms