Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Rhox9Q9EQM5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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