Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Cxcr6Q9EQ16 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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