Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rnft1Q9DCN7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rnft1Q9DCN7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms