Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pop7Q9DCH2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pop7Q9DCH2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms