Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hmgn3Q9DCB1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hmgn3Q9DCB1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hmgn3Q9DCB1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hmgn3Q9DCB1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hmgn3Q9DCB1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hmgn3Q9DCB1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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