Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hmg20aQ9DC33 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hmg20aQ9DC33 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms