Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rnf6Q9DBU5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms