Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc97Q9DBT3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc97Q9DBT3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms