Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SelenooQ9DBC0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms