Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp8Q9DB85 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp8Q9DB85 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms