Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB16

Cab39l, Calcium-binding protein 39-like, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39lQ9DB16 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cab39lQ9DB16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cab39lQ9DB16 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms