Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc89Q9DA73 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms