Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q9DA42 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q9DA42 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q9DA42 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Q9DA42 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Q9DA42 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms