Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rsph9Q9D9V4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rsph9Q9D9V4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms