Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cnot8Q9D8X5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cnot8Q9D8X5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms