Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L5

Ccdc91, Coiled-coil domain-containing protein 91, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc91Q9D8L5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc91Q9D8L5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc91Q9D8L5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms