Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Arpc5lQ9D898 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Arpc5lQ9D898 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms