Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vstm5Q9D806 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms