Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Z6

Clca1, Calcium-activated chloride channel regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca1Q9D7Z6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Clca1Q9D7Z6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clca1Q9D7Z6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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