Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Length 220 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn22Q9D7U6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms