Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Echdc3Q9D7J9 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Echdc3Q9D7J9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms