Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cldn23Q9D7D7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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