Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cmtm5Q9D6G9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms