Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PudpQ9D5U5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PudpQ9D5U5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms