Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccdc130Q9D516 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc130Q9D516 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms