Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tubgcp4Q9D4F8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tubgcp4Q9D4F8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Tubgcp4Q9D4F8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Tubgcp4Q9D4F8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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