Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp2bpQ9D4C6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Lrp2bpQ9D4C6 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms