Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Syce1Q9D495 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Syce1Q9D495 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms