Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tchhl1Q9D3P1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tchhl1Q9D3P1 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tchhl1Q9D3P1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tchhl1Q9D3P1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tchhl1Q9D3P1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tchhl1Q9D3P1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms