Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9D3J9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Q9D3J9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms