Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3B1

Hacd2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd2Q9D3B1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hacd2Q9D3B1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms