Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Snx20Q9D2Y5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Snx20Q9D2Y5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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