Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed11Q9D2R4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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