Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim42Q9D2H5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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