Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bcas2Q9D287 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms