Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SarnpQ9D1J3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SarnpQ9D1J3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms