Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H6

Ndufaf4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf4Q9D1H6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufaf4Q9D1H6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufaf4Q9D1H6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms