Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Susd3Q9D176 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms